| Oberliga Bayern 1998/99 |
| 1. | SV Lohhof | 34 | 59:27 | 65 |
| 2. | SG Quelle Fürth | 34 | 79:38 | 63 |
| 3. | SC Schwabach (N) | 34 | 58:38 | 61 |
| 4. | SpVgg Stegaurach | 34 | 76:52 | 58 |
| 5. | SpVgg Weiden | 34 | 48:34 | 58 |
| 6. | Jahn Forchheim | 34 | 59:38 | 57 |
| 7. | 1.FC Nürnberg A (N) | 34 | 59:44 | 54 |
| 8. | FC Memmingen | 34 | 64:48 | 52 |
| 9. | 1.SC Feucht | 34 | 65:66 | 47 |
| 10. | SpVgg Landshut | 34 | 48:51 | 47 |
| 11. | TSV Aindling | 34 | 49:57 | 44 |
| 12. | FC Starnberg | 34 | 46:66 | 39 |
| 13. | 1.FC Passau | 34 | 39:54 | 38 |
| 14. | Bayern Hof | 34 | 39:56 | 35 |
| 15. | Schwaben Augsburg (N) | 34 | 47:68 | 35 |
| 16. | SG Post/Süd Regensburg | 34 | 45:63 | 34 |
| 17. | SpVgg Bayreuth (N) | 34 | 41:78 | 28 |
| 18. | VfL Frohnlach | 34 | 20:73 | 20 |
Aufsteiger: FC Kempten, FV Würzburg 04, Jahn Regensburg, SpVgg Ansbach
Aus der Regionalliga: SC Weismain